上海交通大學醫(yī)學院（Shanghai Jiao Tong University School of Medicine）由中華人民共和國教育部、中華人民共和國衛(wèi)生部和上海市人民政府共建，位列“211工程”、“985工程”、“雙一流”，入選中國首批“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃”，是國家級臨床技能實驗示范中心學科組長單位。

上海交通大學醫(yī)學院前身是由圣約翰大學醫(yī)學院、震旦大學醫(yī)學院、同德醫(yī)學院于1952年全國高等學校院系調(diào)整時合并而成的上海第二醫(yī)學院；1985年，更名為上海第二醫(yī)科大學。1997年，學校通過了“211工程”立項。2005年7月18日，上海交通大學與上海第二醫(yī)科大學合并，成立了由教育部、上海市人民政府重點共建的上海交通大學醫(yī)學院，進入“985”高校行列。2010年11月，學院成為衛(wèi)生部與教育部合作共建的第一批十個重點高校中的一員。

截至2013年12月底，學院擁有重慶南路、閔行、南匯三個校區(qū)，下設(shè)23個學院（系）、14所附屬醫(yī)院、1所衛(wèi)生學校，開辦10個本科專業(yè)（方向）；有教職醫(yī)務(wù)員工22707名，專任教師634名；有在校學生6828名，其中本科及長學制學生2723名，研究生3842名，留學生263名。

• 上海交通大學醫(yī)學院

2005年，上海交通大學、上海第二醫(yī)科大學正式合并。新的上海交通大學為教育部直屬高校，在原上海第二醫(yī)科大學和原上海交通大學醫(yī)學院基礎(chǔ)上，組建上海交通大學醫(yī)學院。教育部和上海市政府將合作共建上海交通大學醫(yī)學院。同年，醫(yī)學教育發(fā)展與研究中心、二醫(yī)大生命醫(yī)學倫理中心成立揭牌成立。附屬寶鋼醫(yī)院改名為附屬第三人民醫(yī)院。上海市教委批準原上海第二醫(yī)科大學衛(wèi)生技術(shù)學院為獨立設(shè)置的全日制高等學院?上海衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學院，由上海市教委與上海交通大學醫(yī)學院雙重領(lǐng)導。6月，醫(yī)學教育發(fā)展與研究中心對二醫(yī)大二級學院及相關(guān)部處開展自2003年教學評估以來首次教育教學整改驗收工作，驗收采取發(fā)展性教學評價，對學校各方面所采取的措施及成效等內(nèi)容進行驗收。

2006年，醫(yī)學院“十五”、“211工程”建設(shè)項目接受并通過專家組評審驗收。同年，上海交大醫(yī)學院數(shù)字醫(yī)學研究院成立。上海交通大學人文與衛(wèi)生管理學院（上海交通大學國藥人文與衛(wèi)生管理學院）更名為上海交通大學公共衛(wèi)生學院。上海市精神衛(wèi)生中心、中國福利會國際和婦幼保健院正式成為上海交大醫(yī)學院附屬醫(yī)院。

2007年，醫(yī)學院婦產(chǎn)科學研究所、上海交通大學醫(yī)學院上海干細胞研究所、醫(yī)學院精神衛(wèi)生學系、婦產(chǎn)科學系、兒科學系分別成立。上海交通大學醫(yī)學院蘇州九龍醫(yī)院開業(yè)。醫(yī)學院中法醫(yī)學部、上海交通大學醫(yī)學科學研究院分別舉行揭牌儀式。

2008年，上海國際造口治療師學校在醫(yī)學院附屬第九人民醫(yī)院揭牌成立。本年度首次在學生中嘗試中國國內(nèi)外聯(lián)合培養(yǎng)“MD+PhD”雙學位研究生。

2015年，上海交通大學醫(yī)學院附屬衛(wèi)生學校和上海市衛(wèi)生學校合并組建成立上海健康醫(yī)學院附屬衛(wèi)生學校。