學(xué)校以理工科為主，設(shè)立物質(zhì)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、創(chuàng)業(yè)與管理學(xué)院和創(chuàng)意與藝術(shù)學(xué)院，實行大學(xué)院制，學(xué)院下不設(shè)系。學(xué)校設(shè)立免疫化學(xué)研究所、iHuman研究所和數(shù)學(xué)科學(xué)研究所和通識教育中心。

學(xué)校按照1:10–1:12的師生比建設(shè)一支1000人規(guī)模的教授隊伍，規(guī)劃選聘500位常任教授和500位特聘教授。其中，常任教授主要來源于國際著名大學(xué)的知名學(xué)者和優(yōu)秀青年學(xué)者，實行常任教授制（Tenure System）；特聘教授主要來源于中科院上海分院研究院所的優(yōu)秀科學(xué)家以及國內(nèi)外著名教授。截至2017年12月，學(xué)校已選聘448位教授（特聘教授291位、常任教授到位155位，教學(xué)教授2位）。其中包括諾貝爾獎獲得者3位、美國國家科學(xué)院院士6位、英國皇家學(xué)會院士2位、中國科學(xué)院院士28位、中國工程院院士3位、“中央千人”24位、“外專千人”2位、“上海千人”14位、“青年千人”35位、“杰青”95位。

學(xué)校培養(yǎng)本科生、碩士研究生、博士研究生以及專業(yè)學(xué)位研究生，在校學(xué)生規(guī)模規(guī)劃為本科生2000名，研究生4000名。截至2017年12月，學(xué)校共有在籍學(xué)生約2700人，其中本科生1198人，碩士研究生1098人，中科院聯(lián)培博士研究生400人。學(xué)校面向全國9省市招收了首屆207名本科生，2016年面向14省市招收了355名本科生，2017年面向14省招收了356名本科生。2013年學(xué)校招收了首屆296名中科院聯(lián)培研究生，2016年招收了432名中科院聯(lián)培研究生，2017年學(xué)校首次獨立自主招收465名研究生。

學(xué)校圍繞“服務(wù)國家經(jīng)濟社會發(fā)展戰(zhàn)略”的辦學(xué)使命，建立學(xué)院專業(yè)能力培養(yǎng)—書院綜合素質(zhì)培養(yǎng)結(jié)合、學(xué)—研結(jié)合、學(xué)—創(chuàng)結(jié)合的人才培養(yǎng)機制，注重培養(yǎng)學(xué)生“立志、成才、報國、裕民”的社會責(zé)任感，具備扎實的科學(xué)技術(shù)背景和創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)意識，深入了解中國傳統(tǒng)文化和國情，同時具有國際視野，成長為從事科學(xué)發(fā)現(xiàn)、高技術(shù)創(chuàng)新與新興產(chǎn)業(yè)創(chuàng)業(yè)的拔尖人才。

本科生培養(yǎng)遵循“寬口徑、厚基礎(chǔ)、小規(guī)模、國際化”的原則，突出“通（通識教育）、專（專業(yè)人才）、新（創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)）”的，建立了由專業(yè)教育、通識教育、個性化教育構(gòu)成的本科培養(yǎng)體系，專業(yè)課程體系和標(biāo)準(zhǔn)與世界一流大學(xué)接軌，選用國際經(jīng)典教材；所有本科生必修數(shù)、理、化、生、信息，打下堅實理工科基礎(chǔ)；加強中華文明、世界文明、科技文明教育，注重創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育。學(xué)校為每位本科生配備導(dǎo)師，在學(xué)習(xí)生活、創(chuàng)新實踐、生涯規(guī)劃等多方面為學(xué)生提供指導(dǎo)。學(xué)校注重將創(chuàng)新實踐融入培養(yǎng)全過程：2017年，全體2016級本科生前往全國13個基地開展暑期社會實踐活動，全體2015級本科生和部分研究生前往50家企業(yè)和園區(qū)開展暑期產(chǎn)業(yè)實踐活動，30%的大二大三本科生在學(xué)院/研究所實驗室參與科研實踐活動。學(xué)校致力于構(gòu)建國際化的學(xué)習(xí)環(huán)境，為優(yōu)秀學(xué)生提供充足的海外學(xué)習(xí)交流機會：2017年93名本科生赴加州大學(xué)伯克利分校、芝加哥大學(xué)、意大利帕多瓦大學(xué)、耶魯大學(xué)進行暑期課程學(xué)習(xí)和交流。2017年秋季，我校派出了21名優(yōu)秀本科生赴哈佛大學(xué)、麻省理工學(xué)院進行一學(xué)期或一學(xué)年的專業(yè)課程學(xué)習(xí)和交流。

研究生培養(yǎng)以學(xué)術(shù)型博士為重點，兼顧一部分應(yīng)用型碩士。自2013年成立以來，依托中科院上海分院各研究院所開展研究生培養(yǎng)，首屆（2013級）118名中科院聯(lián)培碩士研究生已順利畢業(yè)，整體就業(yè)升學(xué)率100%。學(xué)校已獲教育部批準(zhǔn)，將結(jié)合上海科創(chuàng)中心建設(shè)以及上海市教育綜合改革，從2017年起在7個一級學(xué)科獨立招收和培養(yǎng)碩士和博士研究生。

學(xué)校瞄準(zhǔn)物質(zhì)科學(xué)與技術(shù)、生命科學(xué)與技術(shù)和信息科學(xué)與技術(shù)的前沿領(lǐng)域同時開展教授個體科研和圍繞重大目標(biāo)的團隊科研，推動學(xué)科交叉融合、大學(xué)與國家級科研機構(gòu)融合，構(gòu)建科技進步驅(qū)動產(chǎn)業(yè)發(fā)展的完整創(chuàng)新價值鏈，針對國家在轉(zhuǎn)型發(fā)展過程中所面臨的一系列嚴(yán)峻挑戰(zhàn)，探索基于科技創(chuàng)新的解決方案。目前，物質(zhì)、信息、生命、創(chuàng)管學(xué)院以及免疫化學(xué)研究所、iHuman研究所已制定了學(xué)科/臺建設(shè)規(guī)劃，常任教授、科研人員正陸續(xù)到位，截至2017年9月已建立145個研究組，科研工作全面開展，截至2017年9月，學(xué)�？蒲腥藛T共參與發(fā)表科研論文1379篇，其中上科大為第一單位598篇，“成功解析人源大麻素受體三維結(jié)構(gòu)”等高水科研成果開始涌現(xiàn)。學(xué)校全力推進科技與教育的融合，參與中科院牽頭的國家級科研項目，與中科院相關(guān)院所建立聯(lián)合實驗室開展全面科研合作，2017年10月超強激光光源聯(lián)合實驗室實現(xiàn)10拍瓦（1拍瓦=1千萬億瓦）激光脈沖輸出，達到國際領(lǐng)先水。學(xué)校積極推動科教與產(chǎn)業(yè)的融合，與多家國內(nèi)外高科技企業(yè)開展產(chǎn)學(xué)研合作，技術(shù)成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化取得一系列進展。

2016年4月15日，國務(wù)院發(fā)布《上海系統(tǒng)推進全面創(chuàng)新改革試驗加快建設(shè)具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心方案》，明確指出上科大在上海張江綜合性國家科學(xué)中心建設(shè)中承擔(dān)重要任務(wù)。目前，學(xué)校正與中科院上海分院科研院所等單位合作，負(fù)責(zé)或參與建設(shè)軟X射線自由電子激光用戶裝置、活細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能成像等線站工程、超強超短激光實驗裝置、上海光源二期線站工程（納米自旋與磁學(xué)線站、高性能膜蛋白晶體學(xué)線站），牽頭硬X射線自由電子激光裝置的規(guī)劃和建設(shè)，承擔(dān)“多空間多時間尺度生物成像臺”“機器學(xué)習(xí)與虛擬現(xiàn)實臺”等科創(chuàng)中心建設(shè)重點建設(shè)工作，力爭為上�？苿�(chuàng)中心建設(shè)做出重要貢獻。

學(xué)校積極投身教育全球化，與多所國際一流大學(xué)在學(xué)生培養(yǎng)、教師培訓(xùn)、課程共享、學(xué)術(shù)交流、合作科研等方面開展全方位務(wù)實合作，并積極拓展與國內(nèi)一流大學(xué)的交流合作關(guān)系。目前學(xué)校已與芝加哥大學(xué)、麻省理工學(xué)院、加州大學(xué)伯克利分校、哈佛大學(xué)、耶魯大學(xué)、康奈爾大學(xué)、賓夕法尼亞大學(xué)、帕多瓦大學(xué)、牛津大學(xué)、德雷塞爾大學(xué)等歐美知名高校建立了良好的合作關(guān)系，在學(xué)生交流、課程開發(fā)、教師交流等方面開展項目合作，合作院校還在不斷增加。