其中臨床醫(yī)學進入ESI學科排名的全球前1%，是廣東省擁有ESI排名全球前1%學科7所高校之一。學校具有研究生推免資格，有一級學科碩士授權(quán)點5個，二級學科碩士授權(quán)點35個，有一級學科博士授權(quán)點1個（臨床醫(yī)學，涵蓋20個二級學科，16個三級學科），設(shè)有一級學科（臨床醫(yī)學）博士后流動站。此外，學校擁有5個國家級臨床重點�？�，39個省級臨床重點�？啤�
學校設(shè)有呼吸疾病研究所、蛇毒研究所、中西醫(yī)結(jié)合研究所、神經(jīng)科學研究所、化學致癌研究所、腫瘤研究所、人文社會科學研究所、婦產(chǎn)科學研究所、心血管疾病研究所、骨科研究所、高等教育研究所、免疫研究所、泌尿外科研究所等13個研究所。設(shè)有廣東省倫理學研究中心、廣東省窺鏡外科研究開發(fā)中心、廣東省呼吸醫(yī)學工程技術(shù)研究開發(fā)中心、藥物研究中心。呼吸疾病實驗室是廣東省地方高校中第一個國家重點實驗室，神經(jīng)遺傳與離子通道病重點實驗室是教育部與廣東省共建重點實驗室。另外擁有省級重點實驗室6個、廳市級重點實驗室12個。年來，學校承擔國家“973”、“863”等重大科研項目多項，在《自然醫(yī)學》、《柳葉刀》等世界知名雜志上發(fā)表多篇高水論文。
學校主辦的學術(shù)刊物有《廣州醫(yī)科大學學報》、《中華生物醫(yī)學工程雜志》、《中華關(guān)節(jié)外科雜志》、《血栓與止血學雜志》、《CHEST》（中文版）、《J Thoracic Disease》。其中《J Thoracic Disease》2013年被SCI收錄，《中華生物醫(yī)學工程雜志》2011年被中國核心期刊收錄。
學校先后與美國霍普金斯大學、加州州立大學、馬里蘭大學，法國斯特拉斯堡大學，英國愛丁堡大學、伯明翰大學、胡弗漢頓大學，韓國延世大學，澳大利亞昆士蘭科技大學，香港大學、香港中文大學、香港理工大學，臺灣義守大學、臺灣中山醫(yī)學大學等高等院校和研究部門開展合作辦學和學術(shù)交流活動。有一批國外著名高校專家被聘為學校特聘教授、名譽教授或客座教授。
半個世紀的薪火相傳，學校堅持發(fā)揚廣醫(yī)大學精神，實施“學科強校、人才興校、附屬醫(yī)院組團發(fā)展”三大戰(zhàn)略，與時俱進，開拓進取，從整體上提升了學校辦學的核心競爭力，實現(xiàn)了自身的快速發(fā)展和辦學水的不斷提高，為創(chuàng)建較高水的教學研究型醫(yī)科大學奠定了堅實的基礎(chǔ)。

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